深圳航空在1号航站楼新加坡航站楼分布三座航站楼的航空公司各有侧重，寰宇一家成员集中在T1，天合联盟成员主要分布在T2，而以基地航空公司新加坡航空为主的星空联盟成员则使用T3，具体分布如下：一号航站楼(T1)中国国际航空、法国航空、毛里求斯航空、新几内亚航空、亚洲航空、亚洲航空(泰国)、亚洲航空(印尼)、曼谷航空、孟加拉航空、英国航空、国泰航空、中华航空、中国南方航空、达美航空、不丹皇家航空、阿联酋航空、长荣航空、芬兰航空、黄金缅甸航空、日本航空、捷星航空、捷星亚洲航空、荷兰皇家航空、缅甸国际航空、菲律宾航空、澳洲航空、深圳航空、泰国国际航空、惠旅航空、厦门航空二号航站楼(T2)印度航空、印度航空快运、菲鹰航空、全日空、宿雾太平洋航空、阿提哈德航空、飞萤航空、海南航空、印地哥航空、大韩航空、老挝航空、汉莎航空、马来西亚航空、欣丰虎航、文莱皇家航空、酷航、胜安航空、三佛齐航空、瑞士国际航空、复兴航空三号航站楼(T3)新加坡航空、韩亚航空、中国东方航空、印尼鹰航空、捷特航空、印尼狮航空、卡塔尔航空、沙特阿拉伯航空、四川航空、斯里兰卡航空、美国联合航空、越南航空